Alfons Mardani lahir di Boro, Kulon Progo, Yogyakarta, 1968. Setelah lulus dari Seminari Menengah St. Petrus Canisius, Mertoyudan (1988), dia singgah di Postulat OFM Biara Bonaventura, Pringwulung, Yogyakarta (1989), kemudian kuliah di Jurusan Sosiologi Fakultas Ilmu Sosial dan Ilmu Politik UGM (lulus pada 1996), serta di Magister Ilmu Religi dan Budaya Universitas Sanata Dharma (tidak selesai).

Pendiri Yayasan Sawo Kecik ini terlibat dalam pendampingan anak di Pacitan, Bogor, dan Ponorogo sampai 2001. Dia bergabung dengan Yayasan USC-Satunama di Divisi Training sampai 2005. Alfons adalah dosen tamu di Fakultas Ilmu Sosial dan Ilmu Politik Universitas Atma Jaya Yogyakarta pada 2005–2010. Dia juga terlibat dalam pengkajian pendidikan serta memfasilitasi pelatihan anak dan guru, juga sebagai Pemimpin Redaksi Bulletin Kuwera 14 serta Jurnal Pendidikan Dinamika Edukasi di Yayasan Dinamika Edukasi Dasar Yogyakarta sampai 2010.