A. Setyo Wibowo lahir di Ambarawa, Jawa Tengah. Ia menyelesaikan pendidikan sarjana di Sekolah Tinggi Filsafat (STF) Driyarkara pada 1994, lalu melanjutkan studi magister, diplôme d’études approfondies (DEA), dan doktor filsafat di Université Paris 1 Panthéon-Sorbonne, Prancis (2000–2007). Saat ini ia mengajar di STF Driyarkara dan menjabat sebagai Pemimpin Redaksi majalah Basis. Ia juga mengajar di Program Doktor STIK-PTIK Jakarta, Universitas Sanata Dharma (2014–2023) dan Program Magister Resolusi Konflik Universitas Pertahanan (2012–2019).