Sindhunata adalah rohaniwan, sastrawan, wartawan, dan budayawan. Ia menempuh pendidikan di STF Driyarkara, Jakarta(1974–1980), dan Institut Filsafat Teologi Kentungan, Yogyakarta. Pada 1992, ia meraih gelar doktor filsafat dari Hochschule für Philosophie, München, Jerman, dengan disertasi tentang harapan mesianik masyarakat Jawa.